Στα μαρτυρικά χωριά της Ελλάδος εντάχθηκε κι επίσημα ο Άγιος Θωμάς μετά τη δημοσίευση του προεδρικού διατάγματος υπ. αρ. 32, στις 11 Μαρτίου 2020, το οποίο δημοσιεύτηκε στην εφημερίδα της Κυβερνήσεως στις 12 Μαρτίου 2020 με αρ. φύλλου 59 και αναγνωρίζεται ως Μαρτυρικό Χωριό της περιόδου 1941-1945.
Το σχετικό αίτημα για το χαρακτηρισμό του Αγίου Θωμά είχε υποβάλλει ο Δήμος Τανάγρας τον Ιούνιο του 2019 στην αρμόδια επιτροπή του υπουργείου Εσωτερικών, μετά από ομόφωνη απόφαση του Δημοτικού Συμβουλίου στις 14/3/2019.
Το έγγραφο υλικό και πολλές μαρτυρίες από κατοίκους του χωριού που έζησαν τα γεγονότα της κατοχής συγκέντρωσε και έφερε στο Δημοτικό Συμβούλιο η εκπαιδευτικός-συγγραφέας κα Βουγέση Γεωργία από τον Άγιο Θωμά.
Το υλικό αυτό μαζί με το αίτημα του Δήμου Τανάγρας διαβιβάστηκε στο υπουργείο Εσωτερικών που έκανε δεκτό το αίτημα του Δήμου και στη συνέχεια ο Πρόεδρος της Δημοκρατίας προχώρησε στον χαρακτηρισμό του Άγιου Θωμά ως μαρτυρικό χωριό.
Ως «Μαρτυρικά Χωριά και Πόλεις» χαρακτηρίζονται στην Ελλάδα χωριά ή πόλεις, τα οποία έχουν υποστεί μεγάλες καταστροφές από ξένους εισβολείς ή κατακτητές σε περιόδους πολεμικών συγκρούσεων. Ο χαρακτηρισμός αυτός γίνεται επίσημα με προεδρικό διάταγμα. Αφορά συχνότερα οικισμούς που έχουν υποστεί καταστροφές την περίοδο της Κατοχής (1941 -1944).
Ο Δήμαρχος Τανάγρας Βασίλης Περγάλιας δήλωσε: «Νιώθω βαθιά συγκίνηση που επιτέλους κατορθώσαμε να χαρακτηριστεί ο Άγιος Θωμάς μαρτυρικό χωριό και να πάρει τη θέση που του ανήκει στην ιστορία του τόπου μας. Για την επιτυχία του χαρακτηρισμού του Αγίου Θωμά ως μαρτυρικό χωριό οφείλω να ευχαριστήσω θερμά την εκπαιδευτικό-συγγραφέα κα Βουγέση Γεωργία για την πολύτιμη βοήθειά της σε υλικό που τεκμηρίωσε το δίκαιο αίτημά μας με ιστορικά ντοκουμέντα»